医院占地面积60亩，建筑面积3万平方米。新的中医院在5.12汶川特大地震后由上海市、大连万达集团及其他单位捐资约2亿元修建。住院部设心病科(心血管内科)、肺病科(呼吸内科)、脾胃病科(消化内科)、老年病科、糖尿病专科、儿科、外科(普外、创伤外科、胸外科、神经外科、烧伤科)、骨外科、妇产科、康复理疗科、肛肠科、眼鼻咽喉科、重症监护病区、皮肤科、骨伤科、疼痛科。其中骨外病区、肛肠病区、腰腿痛专科病区是我院"重点专科"，在全市学术界居领先地位，具有显著的中医特色和中西医结合优势。门诊部除常规开设中医、西医、中西医结合临床科室外，设有肝胆病、不孕症、男科、呼吸内科、口腔科等28多个专科门诊，并开展内外科、儿科及妇产科急诊。与第三军医大学合作成立"眼科治疗中心"，开展显微眼科手术及其疑难病症治疗。功能辅助科室设有病理科、输血科、检验科(常规室、生化室、微生物室、免疫室)、彩超室、心电图及视频脑电图室、放射科(普放、CT、数字胃肠)、内窥镜室(胃镜、结肠镜、膀胱镜、鼻咽镜、阴道镜)、手术及麻醉科，消毒供应室。

都江堰市中医院是成都中医药大学教学实习医院，是都江堰市中医药继续教育培训中心。每年在该院进修、实习的大中专院校学生、工矿医院、下级医院进修生近百人次;组织专家讲座、专家查房等数十批次，出色地完成了教学任务，培养出一批批综合素质良好的医护人才。